北京二级消防工程师证书注册需要按照一定的流程进行。首先,申请人应当通过聘用单位向所在地的省级或者地(市)级公安机关消防机构提交注册申请材料。公安机关消防机构收到申请材料后,会进行受理,并对材料进行审查。如果材料齐全、符合法定形式,将出具受理凭证;如果不符合要求,则会出具不予受理凭证并告知申请人需要补正的内容。省级公安机关消防机构将在受理之日起二十日内对申请人条件和材料进行审批,并作出注册决定。最后,省级公安机关消防机构将在作出注册决定之日起十日内领发相应级别的注册证、执业印章,并向社会公告。如果申请人未能在规定的期限内提出注册申请,可以符合相关继续教育要求后再进行申请。以上就是北京二级消防工程师证书注册的流程和要求。